More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1443 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  30.4 
 
 		 331 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 429 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 360 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 352 aa  92.8  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 435 aa  92.8  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  31.98 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 359 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.23 
 
 		 813 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 266 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 414 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.76 
 
 		 450 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 449 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 449 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.76 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.76 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.76 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  25.19 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 844 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.25 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 859 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 840 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 421 aa  86.3  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 867 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 595 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.6 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 843 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.45 
 
 		 825 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  24.7 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.64 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.71 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.82 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 821 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 862 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.38 
 
 		 806 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.71 
 
 		 1144 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 810 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 822 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  30.18 
 
 		 884 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 837 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 822 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 822 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  29.07 
 
 		 891 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 785 aa  79.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>