45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4008 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 583 aa  1187    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 657 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  37.99 
 
 		 667 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 315 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  20.16 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  23.94 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  24.47 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.61 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  20.89 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  19.22 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  23.48 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  23.77 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  24.42 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  23.96 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  23.96 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  19.4 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.28 
 
 		 313 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  21.94 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  30.47 
 
 		 624 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  21.51 
 
 		 291 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 282 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  24.19 
 
 		 282 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  22.05 
 
 		 316 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  45.31 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  23.17 
 
 		 278 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  20.43 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  28.35 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  22.46 
 
 		 282 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  26.42 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  43.75 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  43.75 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  21.27 
 
 		 301 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  26.61 
 
 		 275 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.83 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  41.27 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  19.35 
 
 		 266 aa  44.3  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 779 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>