63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0697 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
509 aa  1028    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  56.95 
 
 
523 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  57.06 
 
 
523 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  57.14 
 
 
523 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  51.04 
 
 
535 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  47.84 
 
 
526 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.45 
 
 
529 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  49.79 
 
 
528 aa  485  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  47.78 
 
 
536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  43.61 
 
 
548 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
476 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 
333 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  24.63 
 
 
330 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 
225 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
320 aa  97.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 
327 aa  96.7  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  27.88 
 
 
313 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 
583 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  22.6 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  25 
 
 
667 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  24.37 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  22.13 
 
 
301 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  24.8 
 
 
265 aa  53.9  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 
261 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  22.47 
 
 
304 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 
426 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 
305 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
356 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  20.97 
 
 
389 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  21.77 
 
 
329 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  28.06 
 
 
301 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  23.14 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29.68 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  23.24 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  19.49 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  21.37 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 
334 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28.03 
 
 
276 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  23.15 
 
 
278 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  21.19 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  23.56 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  21.29 
 
 
366 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  22.73 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  21.46 
 
 
282 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  21.3 
 
 
295 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
359 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 
352 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  26.67 
 
 
682 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  22.26 
 
 
1117 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  23.72 
 
 
366 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 
315 aa  43.9  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  21.24 
 
 
864 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 
308 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  23.58 
 
 
362 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.21 
 
 
173 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  23.01 
 
 
342 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>