45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1690 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 476 aa  962    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  33.23 
 
 		 509 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.77 
 
 		 529 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  28.08 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  28.38 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  25.42 
 
 		 528 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 		 523 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  31.92 
 
 		 523 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  19.1 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  23.85 
 
 		 667 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.91 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  20.31 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  22.42 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  21.85 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 864 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  22.51 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.51 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  24.2 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 685 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 303 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  25.93 
 
 		 275 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  21.26 
 
 		 303 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  21.8 
 
 		 298 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  20.75 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  21.46 
 
 		 795 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  22.84 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 272 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 262 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  27.78 
 
 		 276 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 290 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 266 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>