More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2779 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  56.59 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  39.78 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 526 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 548 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  27.05 
 
 		 535 aa  96.7  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.01 
 
 		 529 aa  92  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 536 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  22.3 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  27.95 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  25.84 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  25.36 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  25.36 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  24.4 
 
 		 657 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  24.35 
 
 		 667 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  21.79 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  38.38 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 840 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  27.47 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 1127 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  28 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  24.2 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  34.38 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  31.43 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.31 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.31 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.31 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 685 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.31 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.16 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 811 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  31.31 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 551 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  23.12 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.75 
 
 		 173 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  31.08 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  36.54 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 547 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.48 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>