More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1508 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
301 aa  600  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  63.96 
 
 
316 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  64.1 
 
 
314 aa  362  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 
359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 
408 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 
333 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 
320 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 
327 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 
315 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.25 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 
225 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
330 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  23.87 
 
 
523 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  23.87 
 
 
523 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  23.87 
 
 
523 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  22.13 
 
 
509 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  27.5 
 
 
526 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  23.42 
 
 
528 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  23.42 
 
 
528 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  27.04 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  27.04 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  27.47 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  23.63 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  26.2 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.38 
 
 
529 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  24.19 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.95 
 
 
813 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.4 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 
548 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
350 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 
657 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  23.19 
 
 
476 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 
427 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  25.74 
 
 
528 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 
779 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 
401 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 
549 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 
536 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  20.36 
 
 
535 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 
369 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  21.61 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 
406 aa  57  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  23.83 
 
 
667 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 
444 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 
401 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 
568 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  23.04 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 
571 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  30.77 
 
 
545 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 
550 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 
439 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  38.33 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 
524 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>