38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1021 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 548 aa  1102    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  51.43 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.62 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  48.77 
 
 		 528 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  48.73 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  49.08 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  43.61 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  45.2 
 
 		 523 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  45.2 
 
 		 523 aa  359  6e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  45.2 
 
 		 523 aa  359  9e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 315 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 225 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.37 
 
 		 313 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 333 aa  93.6  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  20.89 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  18.12 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  20.86 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  17.75 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  22.44 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  20.56 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  31.03 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  28.93 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 289 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.23 
 
 		 276 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 284 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 		 274 aa  43.9  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  21.78 
 
 		 291 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  23.87 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 261 aa  43.5  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>