74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0782 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  98.47 
 
 		 523 aa  1042    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  98.85 
 
 		 523 aa  1045    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 523 aa  1054    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  58.54 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  51.19 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  50.84 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  50.1 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.56 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  47.31 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  45.2 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 315 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  24.01 
 
 		 330 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 327 aa  96.7  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 320 aa  94.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 333 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  24.53 
 
 		 313 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  22.94 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  23.87 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.93 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  22.78 
 
 		 657 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  23.58 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  21.73 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 864 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  22.64 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  22.64 
 
 		 362 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 		 338 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.18 
 
 		 624 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 279 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 308 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  20.35 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  21.52 
 
 		 408 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  22.15 
 
 		 282 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  22.03 
 
 		 285 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 305 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 		 322 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  21.9 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  21.84 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  23.73 
 
 		 329 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.53 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  21.01 
 
 		 291 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 426 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  20 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 334 aa  47.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 344 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  22.36 
 
 		 366 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  20.08 
 
 		 364 aa  47  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  26.52 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 266 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  21.26 
 
 		 301 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 		 362 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  23.43 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  23.9 
 
 		 816 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  22.52 
 
 		 1111 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  22.07 
 
 		 293 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 		 303 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  19.79 
 
 		 345 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.32 
 
 		 173 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.06 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  22.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 359 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  21.12 
 
 		 369 aa  43.5  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>