48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0855 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  59.4 
 
 		 529 aa  641    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 526 aa  1057    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  61.38 
 
 		 528 aa  634  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  58.53 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  53.64 
 
 		 536 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  48.77 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  50.88 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  51.07 
 
 		 523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  50.88 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  48.73 
 
 		 548 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 327 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  27.08 
 
 		 313 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  22.76 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 333 aa  91.3  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  20.16 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  20.49 
 
 		 657 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  21.15 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  26.9 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  20.42 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  21.89 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  20.88 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.23 
 
 		 276 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  23.11 
 
 		 305 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 291 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  21.36 
 
 		 304 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  25.36 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  21.19 
 
 		 624 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 		 238 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  22.13 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  22.92 
 
 		 287 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  21.15 
 
 		 362 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  20 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  21.86 
 
 		 360 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>