More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0786 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 327 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  37.07 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 		 225 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.25 
 
 		 529 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 548 aa  119  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  26.69 
 
 		 526 aa  116  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  27.63 
 
 		 528 aa  113  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  26.21 
 
 		 535 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 536 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  23.92 
 
 		 509 aa  95.9  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  27.08 
 
 		 667 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 657 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  25.68 
 
 		 523 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  25.68 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  25.23 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  27.65 
 
 		 1128 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  24.37 
 
 		 1127 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  29.66 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  24.91 
 
 		 1111 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  25.82 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  25.82 
 
 		 1120 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  25.82 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  25.82 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  25.82 
 
 		 1120 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1120 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.37 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1118 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1120 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1120 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  27.83 
 
 		 1130 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  26.14 
 
 		 1133 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  26.17 
 
 		 1134 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  28.02 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  26.17 
 
 		 1134 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  27.15 
 
 		 1098 aa  69.3  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  24.17 
 
 		 1102 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 859 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  25.34 
 
 		 1117 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  26.96 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  26.96 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  26.96 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.6 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 843 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 820 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 820 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 842 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  24.62 
 
 		 1115 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1102 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 981 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 600 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 840 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  31.06 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  24.75 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  29.2 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28.82 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  36 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.67 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 807 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 845 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 814 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 636 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 816 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.58 
 
 		 813 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 832 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>