More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0108 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 291 aa  580  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  39.84 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  41.4 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  29.24 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  30.8 
 
 		 264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  41.4 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  31.69 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
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NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  30.65 
 
 		 794 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
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NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 779 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 816 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 814 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 814 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 369 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 817 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.54 
 
 		 366 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 815 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 840 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 849 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 808 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 809 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 809 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.07 
 
 		 809 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 820 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 814 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 820 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 874 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
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NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 832 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  27.44 
 
 		 847 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 773 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 847 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 856 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 		 883 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 853 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
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NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  22.99 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 909 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
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NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 909 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
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NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 832 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 947 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
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NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 879 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
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NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 		 833 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.23 
 
 		 806 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  30.71 
 
 		 1117 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 817 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 813 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 835 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25.95 
 
 		 891 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 830 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 840 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 785 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  27.52 
 
 		 1134 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  27.52 
 
 		 1134 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 815 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  26.85 
 
 		 1111 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  26.85 
 
 		 1102 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  42.31 
 
 		 983 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  34.86 
 
 		 806 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  42.31 
 
 		 983 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 860 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  34.86 
 
 		 807 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  26.85 
 
 		 1102 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1108 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  22.67 
 
 		 1144 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1108 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1108 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1108 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
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NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 435 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1108 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  43.37 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  28.75 
 
 		 803 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  28.83 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
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NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 685 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  21.59 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  21.59 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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