More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2854 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  67.88 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  64.1 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  27.67 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  26.85 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  25.93 
 
 		 523 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  25.93 
 
 		 523 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  27.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  25.5 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  24.37 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  28.89 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  26.06 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  23.08 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.9 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  26.57 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  23.67 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  26.57 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  26.57 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  26.57 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  26.57 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.36 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  30.71 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  22.17 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.33 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  23.23 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  25.86 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.87 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  23.94 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  22.51 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  21.94 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  26.64 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.4 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.4 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  24.55 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  20.89 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>