98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2824 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 330 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.33 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  26.71 
 
 		 526 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.65 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  26.3 
 
 		 535 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  24.63 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 548 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  26.2 
 
 		 523 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  24.25 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  26.2 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  26.2 
 
 		 523 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  21.43 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  24.89 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  19.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  19.83 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  21.05 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  19.5 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  24.77 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  21.47 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.45 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  22.37 
 
 		 563 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.29 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 544 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  23.21 
 
 		 633 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  24.27 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  20.19 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.53 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  20.45 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  20.59 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  21.84 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  24.3 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 538 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  21.5 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  23.63 
 
 		 532 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  24.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  24.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 843 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  24.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  24.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  25.98 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  23.46 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 807 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  20.51 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  23.43 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  24.02 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  20.69 
 
 		 795 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  24.3 
 
 		 844 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 840 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1120 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  23.73 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  20.66 
 
 		 820 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  22.89 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1118 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  23.17 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1120 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 811 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1118 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1118 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  23.59 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  19.92 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 389 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  21.08 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 549 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22.56 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  19.9 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  20.86 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  23.73 
 
 		 847 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>