More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0806 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 549 aa  1112    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  61.05 
 
 		 571 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  51.3 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  41.52 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  36.77 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  35.83 
 
 		 563 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 563 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 572 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  33.4 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 593 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 570 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  39.83 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 545 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 545 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  33.26 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  29.42 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  39.49 
 
 		 538 aa  239  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 546 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 		 481 aa  231  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  43.3 
 
 		 230 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  24.58 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  21.45 
 
 		 685 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  23.43 
 
 		 636 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 636 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.73 
 
 		 1144 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 289 aa  103  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 310 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 287 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 358 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 		 299 aa  96.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  27.27 
 
 		 1117 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  23.62 
 
 		 444 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 362 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 298 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  24.52 
 
 		 1111 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 447 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 274 aa  91.3  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 280 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.1 
 
 		 291 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  23.75 
 
 		 1134 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 270 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 275 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 345 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  21.25 
 
 		 1102 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  21.47 
 
 		 1117 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  21.25 
 
 		 1102 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  23.43 
 
 		 1134 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 362 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 322 aa  87  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 361 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 840 aa  87  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 400 aa  87  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  26.55 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 1166 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  26.55 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  26.55 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  26.55 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  26.11 
 
 		 286 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25.66 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 874 aa  85.1  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  25.66 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  21.55 
 
 		 1102 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  22.69 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  21.55 
 
 		 1102 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  23.04 
 
 		 861 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  30.6 
 
 		 782 aa  84.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.88 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  25.21 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  23.17 
 
 		 867 aa  83.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 847 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>