More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1278 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  100 
 
 		 520 aa  1046    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  48.58 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  49.3 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  47.12 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  44.58 
 
 		 563 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  46.13 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  43.8 
 
 		 593 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  45.74 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  45.74 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  42.43 
 
 		 570 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  42.18 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  45.93 
 
 		 572 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  39.4 
 
 		 524 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  39.83 
 
 		 549 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  43 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  43 
 
 		 545 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  40.06 
 
 		 556 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 538 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 557 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  34.73 
 
 		 581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  33.69 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  37.12 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 230 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 548 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 358 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.43 
 
 		 1144 aa  84  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.04 
 
 		 1067 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 1067 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 1067 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 1067 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  30.52 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 1072 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 1072 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 1067 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 1072 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  25.24 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  26.44 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.6 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 861 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  26.57 
 
 		 1068 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 1127 aa  70.1  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 1235 aa  70.1  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 1070 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  24.21 
 
 		 862 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  27.62 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  24.88 
 
 		 1080 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.82 
 
 		 825 aa  67.8  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  26.15 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  32.5 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 1066 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 1166 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 1062 aa  67  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  27.06 
 
 		 1128 aa  67  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 270 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 258 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 267 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  24.24 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  23.36 
 
 		 1118 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  23.36 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>