More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1734 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 358 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  44.72 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  48.4 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 571 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 563 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 563 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 600 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 563 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 549 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  27.91 
 
 		 545 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 563 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 593 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 579 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 559 aa  95.9  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 550 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 566 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 545 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 545 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 545 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 545 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 581 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  25.83 
 
 		 1144 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.11 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.64 
 
 		 806 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.23 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  22.75 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 840 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 843 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  29.21 
 
 		 633 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 844 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 803 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  26.42 
 
 		 804 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  31.88 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 817 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  27.62 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  20.45 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0812  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 643 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.459246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  28.5 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 794 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 803 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  28 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 820 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 820 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 856 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 814 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  23.05 
 
 		 849 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  23.17 
 
 		 1235 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.41 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  23.7 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.4 
 
 		 825 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 879 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  28.36 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  23.74 
 
 		 773 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 832 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 816 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 835 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>