More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0330 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  46.67 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  43.61 
 
 		 238 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  40.07 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  38.25 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  35.68 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  31.62 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  28.97 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 830 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 1166 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  28.8 
 
 		 794 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 862 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  29.41 
 
 		 983 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  27.92 
 
 		 983 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 779 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.11 
 
 		 806 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  28.72 
 
 		 1120 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  28.72 
 
 		 1120 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  28.72 
 
 		 1120 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 807 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 636 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 636 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 		 784 aa  79  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.34 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.6 
 
 		 1118 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.6 
 
 		 1118 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  27.6 
 
 		 1118 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.6 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  25.26 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  27.6 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1118 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  33.81 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  29.15 
 
 		 1111 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 864 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  29.63 
 
 		 1128 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  28.57 
 
 		 1133 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 752 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  29.68 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.19 
 
 		 807 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  27.72 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 814 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 820 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 820 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  24.64 
 
 		 1134 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 843 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  24.64 
 
 		 1134 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  25.75 
 
 		 1118 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 816 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1107 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  25.75 
 
 		 1118 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 803 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  26.79 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  26.79 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  26.09 
 
 		 847 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 803 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  28.88 
 
 		 1130 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  26.79 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.79 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>