More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2715 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 270 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  44.26 
 
 		 373 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  40.08 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  39.59 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
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NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  35.68 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  34.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  29.11 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.2 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 874 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 593 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  28.87 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 849 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 830 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
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NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  38.94 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 909 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  32.88 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  29.83 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
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NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 860 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
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NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 947 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 563 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 909 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 563 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  31.72 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 636 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 636 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 879 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
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NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.67 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
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NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  25.88 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 817 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.71 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.38 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 807 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 784 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  31.72 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  39.81 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 883 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 867 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 910 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 864 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 868 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  44 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  41.86 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
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NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  24.05 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.55 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  40.7 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  40.7 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.17 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 796 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  40.7 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
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NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
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NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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