More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1137 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  47.97 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  45.98 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  30.48 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  34.1 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  26.42 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  29.83 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 794 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 809 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 817 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 779 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  33.61 
 
 		 494 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  25.73 
 
 		 773 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  37.23 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.19 
 
 		 806 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  25.93 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.93 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  28.19 
 
 		 807 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  25.93 
 
 		 808 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  25.93 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 820 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 814 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 820 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 803 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.68 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 855 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 860 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 849 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 814 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 853 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  36.17 
 
 		 847 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 813 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  36.17 
 
 		 847 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 637 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  33.71 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 803 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 814 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 832 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  29.73 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  25.93 
 
 		 813 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 866 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 832 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 856 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 796 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 716 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 830 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  25.79 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  27.73 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.06 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  27.73 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.93 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  23.6 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  32.17 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>