More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1914 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  47.97 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  32.13 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  32.33 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  33.47 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  28.4 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  31.21 
 
 		 682 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29 
 
 		 624 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  36.75 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 362 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.76 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.14 
 
 		 806 aa  72  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  28.95 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  32.7 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  28.69 
 
 		 825 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  32.7 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  30.19 
 
 		 633 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  32.7 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.11 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 556 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 779 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  31.68 
 
 		 983 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  31.68 
 
 		 983 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 840 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 785 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  30.08 
 
 		 891 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.56 
 
 		 813 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 803 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 799 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  31.72 
 
 		 624 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 855 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  34.51 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  27.61 
 
 		 806 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.63 
 
 		 807 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 		 809 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  24.14 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.03 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 853 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 843 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.58 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  24.03 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 849 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>