More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02267 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  593  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  70.73 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  70.28 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  46.77 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  35.94 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  31.34 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  28.97 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  29.18 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 362 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 341 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  25.74 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.1 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 637 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 636 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 636 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 860 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 874 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  26.98 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 685 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 428 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  21.91 
 
 		 806 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  26.09 
 
 		 732 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 883 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 843 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 879 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 866 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 435 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 444 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 752 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.61 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  23.56 
 
 		 845 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 910 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 1166 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 840 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 815 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  23.6 
 
 		 1111 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  25.67 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 832 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 816 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  21.69 
 
 		 983 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  24.35 
 
 		 753 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  24.44 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  24.74 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  36.29 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 785 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 891 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 909 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  22.87 
 
 		 807 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 909 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 947 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  25.29 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 814 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 820 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 820 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.56 
 
 		 773 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  24.8 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.04 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  21.69 
 
 		 844 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 808 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>