More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2595 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  825    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  40.96 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  40.05 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  40.67 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  41.11 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  39.66 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.18 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  39.18 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  39.18 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  39.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  41.69 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 451 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  40.61 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  34.78 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  36.91 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  35.73 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  42.68 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  42.39 
 
 		 427 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  44.71 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  43.83 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  36.68 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  37.98 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  38.48 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  38.48 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  34.69 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  31.63 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 806 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.56 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 637 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 860 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 830 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 840 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 636 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 785 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  33.84 
 
 		 891 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.98 
 
 		 773 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  32.07 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 853 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 294 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 813 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 849 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 866 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  31.37 
 
 		 301 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  34.65 
 
 		 806 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.9 
 
 		 825 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 845 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  36.09 
 
 		 1120 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  36.09 
 
 		 1120 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 1166 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  36.09 
 
 		 1120 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 847 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  30.25 
 
 		 847 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  34.21 
 
 		 807 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 832 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  32.77 
 
 		 1133 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  34.1 
 
 		 803 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 843 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  32.41 
 
 		 753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  32.96 
 
 		 1111 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  31.98 
 
 		 809 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  31.98 
 
 		 809 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1107 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.98 
 
 		 809 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>