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for query gene VSAL_I2049 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  86.25 
 
 
291 aa  520  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  72.56 
 
 
292 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  50.2 
 
 
343 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  35.38 
 
 
264 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 
373 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  31.08 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  32.13 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  29.15 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 
238 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 
341 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
362 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  21.77 
 
 
806 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 
360 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  23.87 
 
 
860 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  24.21 
 
 
830 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.53 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 
637 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
868 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.96 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 
636 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 
636 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  23.2 
 
 
874 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  24.31 
 
 
910 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  27.72 
 
 
732 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 
815 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 
832 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  23.14 
 
 
909 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
866 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 
685 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 
909 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 
817 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 
947 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 
815 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 
794 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1115 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 
840 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 
807 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1120 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1120 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1118 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1118 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1118 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  24.74 
 
 
1120 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 
813 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  24.23 
 
 
1118 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  25.39 
 
 
773 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  24.74 
 
 
808 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 
816 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  24.74 
 
 
809 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.74 
 
 
809 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  24.74 
 
 
809 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  26.16 
 
 
1117 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  25.54 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 
843 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  25.81 
 
 
825 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 
844 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
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NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 
859 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
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NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  23.02 
 
 
807 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  23.02 
 
 
806 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 
814 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
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NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.41 
 
 
883 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 
814 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  23.96 
 
 
799 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 
820 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
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