More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0508 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 566 aa  1134    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  55.06 
 
 		 563 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  54.88 
 
 		 563 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  48.94 
 
 		 563 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  48.94 
 
 		 563 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  45.61 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  43.97 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  43.41 
 
 		 545 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  41.34 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  41.6 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  41.31 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  37.08 
 
 		 545 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  36.9 
 
 		 545 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  39.35 
 
 		 556 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 593 aa  346  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  46.13 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  37.42 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 571 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 559 aa  280  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  41.46 
 
 		 481 aa  243  7e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 542 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 581 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 		 230 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  27.25 
 
 		 545 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 395 aa  97.4  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 560 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 		 685 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.37 
 
 		 289 aa  87  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.36 
 
 		 1144 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 287 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.44 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  22.27 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  26.56 
 
 		 270 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 361 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 369 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  22.99 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  27.84 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  26.22 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 267 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 636 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  29.35 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 356 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 299 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.34 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  21.29 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1118 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  24.89 
 
 		 1120 aa  72.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 276 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 298 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 305 aa  72  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  23.12 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  21.4 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  28.02 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 843 aa  71.2  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 867 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  26.86 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25.66 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 1127 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  22.67 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  22.83 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>