More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0364 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 538 aa  1086    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  52.13 
 
 		 545 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  52.51 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  51.74 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 557 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  33.27 
 
 		 559 aa  259  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 571 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  30.76 
 
 		 572 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  51.98 
 
 		 230 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  31.07 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 550 aa  217  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 563 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  30.02 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 545 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  40 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  22.29 
 
 		 548 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  23.13 
 
 		 545 aa  90.5  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 795 aa  87.4  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  24.3 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.08 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2522  hypothetical protein  27.08 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00109923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 860 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 853 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  22.49 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.21 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  24.81 
 
 		 866 aa  70.9  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  26.17 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  22.78 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  27.3 
 
 		 756 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  27.34 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  25.68 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1110 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 784 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  26.72 
 
 		 1117 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.4 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 909 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 305 aa  67  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.87 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  28.89 
 
 		 293 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 909 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 947 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  26.9 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  28.89 
 
 		 293 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.66 
 
 		 1144 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 868 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  25.57 
 
 		 813 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  30.16 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>