More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3231 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 545 aa  1092    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  99.08 
 
 		 545 aa  1082    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  56.31 
 
 		 556 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  52.11 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 563 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 570 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  37.73 
 
 		 579 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  36.9 
 
 		 566 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  36.4 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 600 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 593 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 524 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  40.84 
 
 		 520 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 559 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  30.02 
 
 		 538 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 545 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 548 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 230 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 358 aa  87  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  22.39 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.86 
 
 		 1144 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  25.1 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  26.62 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 322 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  23.74 
 
 		 1118 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  23.74 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  23.74 
 
 		 1120 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  23.74 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  23.74 
 
 		 1120 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  25.12 
 
 		 1118 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  28.78 
 
 		 1128 aa  73.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  26.57 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.05 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  26.34 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1117 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.29 
 
 		 1115 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  22.41 
 
 		 595 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  23.85 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.47 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  29.13 
 
 		 682 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  28.96 
 
 		 794 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.13 
 
 		 289 aa  70.1  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 874 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  28.49 
 
 		 1130 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  28.37 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  24.18 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 1105 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 1166 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.4 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 1127 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 840 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 840 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  27.8 
 
 		 1133 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  21.97 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  24.75 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  22.97 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>