More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1169 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 556 aa  1126    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  55.94 
 
 		 545 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  56.31 
 
 		 545 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  53.3 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  40.22 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  39.49 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  38.7 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  38.7 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  36.96 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 600 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  35.73 
 
 		 545 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 593 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 572 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 550 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  39.52 
 
 		 520 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  29.42 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  29.42 
 
 		 559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  26.65 
 
 		 545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 581 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 230 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 395 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 345 aa  87.4  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  28.74 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.73 
 
 		 414 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  20.27 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 322 aa  72  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  21.91 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  32.93 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  24.6 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  32 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  25.73 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 843 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  28.75 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 406 aa  67  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  25.3 
 
 		 280 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  36.5 
 
 		 753 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 280 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  23.75 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  30.39 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.66 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  29.57 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  25.22 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.11 
 
 		 1144 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  24.31 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.12 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  22.26 
 
 		 1117 aa  63.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22.18 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 362 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  22.53 
 
 		 300 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 864 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  28.66 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  23.23 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  32.1 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  24.17 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  24.17 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  23.7 
 
 		 1120 aa  62  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  24.17 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  24.17 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  23.7 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>