More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3838 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 563 aa  1136    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  98.05 
 
 		 563 aa  1115    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  55.06 
 
 		 566 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  45.16 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  47.46 
 
 		 563 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 563 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  43.73 
 
 		 579 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  44.36 
 
 		 545 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 		 600 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 556 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 		 545 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  39 
 
 		 593 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  45.74 
 
 		 520 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 559 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 542 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  40.09 
 
 		 230 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 545 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 548 aa  170  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 358 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  23.27 
 
 		 685 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 395 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.92 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 270 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  29.89 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 595 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.42 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  25 
 
 		 1144 aa  77  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  23.75 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  25.5 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  25.5 
 
 		 1120 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  25.58 
 
 		 1133 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  25.5 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  25.5 
 
 		 1120 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  25.5 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  24.23 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.29 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25.24 
 
 		 867 aa  74.3  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.77 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  24.64 
 
 		 1080 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  24.88 
 
 		 1067 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1120 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1120 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1120 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1115 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 267 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  28.41 
 
 		 276 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 1067 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 1072 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 1072 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1118 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 1067 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 1072 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 1067 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1120 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  26.25 
 
 		 1128 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>