More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4074 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 572 aa  1164    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  39.96 
 
 		 545 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  39.72 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  41.6 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  39.45 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  38.73 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  39.4 
 
 		 563 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  39.4 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 550 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 593 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 524 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  45.93 
 
 		 520 aa  296  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  34.93 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 559 aa  272  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 545 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 545 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 546 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 481 aa  233  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 581 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 545 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  41.74 
 
 		 230 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 867 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 358 aa  98.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 435 aa  92.8  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 1127 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 429 aa  90.9  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 267 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 859 aa  85.5  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 840 aa  84.3  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25.65 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.84 
 
 		 1144 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  22.37 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.09 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 830 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 844 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 274 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 636 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  22.97 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 860 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4392  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4086  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  24.01 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 1235 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 909 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  23.79 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.55 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  23.58 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 883 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  24.48 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  22.13 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.15 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 947 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  23.95 
 
 		 849 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  23.67 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 909 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  22.48 
 
 		 275 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 879 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  24.05 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>