More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4631 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 581 aa  1146    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  67.41 
 
 		 557 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  39.78 
 
 		 538 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 545 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  37.24 
 
 		 542 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  29.98 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 230 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  30.07 
 
 		 545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 549 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 559 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 600 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  35.31 
 
 		 571 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 563 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 563 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 570 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 563 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 563 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 524 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.73 
 
 		 520 aa  187  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 545 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 326 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00109923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  21.93 
 
 		 545 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.2 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  22.4 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  23.99 
 
 		 867 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  25.94 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  22.36 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 		 844 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 1235 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 981 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  26.92 
 
 		 1111 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  25.23 
 
 		 1144 aa  73.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  24.12 
 
 		 832 aa  73.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 853 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  24.15 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 864 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  21.13 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  28.06 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 860 aa  70.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 879 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  24.91 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 909 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 909 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 883 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 947 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  25.27 
 
 		 1102 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 752 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  25.27 
 
 		 1102 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 868 aa  67.8  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 796 aa  67.8  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  25.23 
 
 		 1134 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 910 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  25.4 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  26.02 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 874 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 280 aa  67  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 859 aa  67.4  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.42 
 
 		 806 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.02 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  23.47 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  24.73 
 
 		 1134 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 877 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>