More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4449 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 546 aa  1103    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  52.29 
 
 		 545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  52.29 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  53.3 
 
 		 556 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 563 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  37.52 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 563 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  38.34 
 
 		 579 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  38.6 
 
 		 545 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 600 aa  349  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 		 566 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  32.25 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 593 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  39.89 
 
 		 520 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 524 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  31.74 
 
 		 559 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 557 aa  189  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 538 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 481 aa  180  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 548 aa  177  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 545 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 230 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 267 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  23.83 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  24.57 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  22.64 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 270 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  23.89 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  21.94 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  22.1 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  21.46 
 
 		 843 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  24.58 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 874 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 867 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  32.06 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22.82 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.49 
 
 		 1144 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.28 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  25.56 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  21.02 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  23.42 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  24.55 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  22.81 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  22.1 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  22.1 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 779 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  22.98 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  29.38 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.03 
 
 		 825 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>