More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3376 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 370 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  28.75 
 
 		 336 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 335 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.46 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.56 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 221 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 337 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  30.62 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  30.57 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  35.37 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  35.37 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  35.37 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  30.05 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  35.37 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  35.37 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 528 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 528 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  36.29 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  36.29 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 549 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.59 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  31.18 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  30.1 
 
 		 656 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 600 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 454 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  30.37 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  32.68 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  30.51 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  31.1 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 864 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  26.34 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  32.68 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2953  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 871 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 773 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 568 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 858 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 837 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  31.2 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 830 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  31.2 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  30.58 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 693 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>