76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1094 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  73.21 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  74.01 
 
 		 282 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  71.58 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  72.4 
 
 		 282 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  71.01 
 
 		 278 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  72.24 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2100  MscS mechanosensitive ion channel  67.87 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  40.89 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 290 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  38.7 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  28.93 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  31.94 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 657 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  26.54 
 
 		 667 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  21.05 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  21.51 
 
 		 583 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  29.69 
 
 		 633 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  24.58 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 400 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  32.14 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.64 
 
 		 682 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  27.36 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  25.37 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.98 
 
 		 825 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  24.57 
 
 		 359 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  23.2 
 
 		 414 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  26.15 
 
 		 806 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.15 
 
 		 807 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  34.44 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  30.28 
 
 		 624 aa  47.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  34.44 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  32.43 
 
 		 624 aa  47  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  34.44 
 
 		 627 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 803 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 803 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  32.94 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 		 809 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  21.64 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  22.56 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 479 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 572 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1010  MscS Mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1197  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 830 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 433 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 820 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 856 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 814 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 835 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 566 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  36.26 
 
 		 545 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 804 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 803 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 490 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 817 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 840 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>