61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3992 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
657 aa  1292    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  90.78 
 
 
667 aa  919    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 
583 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 
315 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 
327 aa  87.8  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 
320 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  19.22 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  19.81 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  24.4 
 
 
313 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  21.54 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  25.1 
 
 
509 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  23.68 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  18.12 
 
 
548 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  26.58 
 
 
291 aa  65.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  23.18 
 
 
536 aa  62.4  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 
408 aa  62  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  38.64 
 
 
624 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  32.17 
 
 
275 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 
301 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  29.65 
 
 
275 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  23.66 
 
 
523 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.68 
 
 
682 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 
315 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  23.21 
 
 
523 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  47.06 
 
 
627 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 
278 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  23.53 
 
 
282 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  22.17 
 
 
523 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 
282 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0647  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
306 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.562263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  27.12 
 
 
281 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 
442 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  45.1 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  25.95 
 
 
282 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  45.1 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.5 
 
 
277 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  24.5 
 
 
891 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 
282 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 
266 aa  48.5  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  34.62 
 
 
624 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 
785 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  34.38 
 
 
633 aa  47  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 
300 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 
294 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 
406 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.25 
 
 
286 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.78 
 
 
288 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 
274 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.63 
 
 
173 aa  44.3  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
426 aa  44.3  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 
271 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
459 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 
287 aa  43.9  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 
173 aa  43.9  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>