51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0086 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 		 529 aa  1085    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  73.69 
 
 		 528 aa  788    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  59.4 
 
 		 526 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  56.76 
 
 		 535 aa  558  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  51.71 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  47.43 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  46.62 
 
 		 548 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  45.47 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  45.37 
 
 		 523 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  45.28 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 327 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 225 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  24.28 
 
 		 313 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  23.51 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  22.4 
 
 		 667 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  23 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 389 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  22.99 
 
 		 329 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  22.82 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.93 
 
 		 362 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  21.67 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  25.81 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 305 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  22.01 
 
 		 360 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 262 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  24.02 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  24.11 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  21.56 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  21.88 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  22.38 
 
 		 408 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  21.37 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 344 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 305 aa  43.5  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>