83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1025 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
523 aa  1055    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  99.24 
 
 
523 aa  1048    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  98.85 
 
 
523 aa  1045    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  58.62 
 
 
509 aa  600  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  50.99 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  50.84 
 
 
528 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  49.9 
 
 
535 aa  485  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.28 
 
 
529 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  46.46 
 
 
536 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  45.2 
 
 
548 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 
315 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 
225 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 
330 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 
320 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 
333 aa  91.3  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  24.15 
 
 
313 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 
316 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  21.58 
 
 
657 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  23.35 
 
 
667 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  21.73 
 
 
360 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 
864 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  22.64 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  23.79 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  22.97 
 
 
338 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  22.33 
 
 
362 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  21.31 
 
 
408 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 
322 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  22.15 
 
 
282 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  22.15 
 
 
296 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 
305 aa  50.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 
344 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  23.73 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.29 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  22.37 
 
 
285 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 
334 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  20 
 
 
291 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  22.36 
 
 
366 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  26.32 
 
 
276 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  21.63 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 
261 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 
256 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  20.69 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  20.59 
 
 
291 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  25.41 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.13 
 
 
281 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  23.18 
 
 
1111 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  22.13 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  20.61 
 
 
262 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 
293 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 
303 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  19.7 
 
 
295 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 
290 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  21.89 
 
 
293 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
238 aa  43.9  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.39 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  21.07 
 
 
275 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  22.89 
 
 
811 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 
342 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
305 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  22.73 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  24 
 
 
279 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  22.71 
 
 
304 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  19.43 
 
 
807 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.32 
 
 
173 aa  43.5  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>