More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08930 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  40.19 
 
 		 320 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  39.18 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  40.1 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 327 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  31.37 
 
 		 526 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 536 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  31.86 
 
 		 509 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 548 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.43 
 
 		 529 aa  99  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  35.44 
 
 		 523 aa  98.6  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  35.44 
 
 		 523 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 333 aa  98.6  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  31.03 
 
 		 535 aa  98.2  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  35.44 
 
 		 523 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  30.11 
 
 		 528 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 359 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 314 aa  92.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 301 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.41 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0647  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.562263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  28.18 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  28.93 
 
 		 983 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  28.93 
 
 		 983 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  30.84 
 
 		 667 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  25.62 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  32.8 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 566 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 362 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 322 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  31.75 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  30.17 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 779 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  24.86 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  23.33 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  24.52 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  24.71 
 
 		 803 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26.29 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 593 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.32 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  27.75 
 
 		 813 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  22.73 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  20.87 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  24.63 
 
 		 794 aa  55.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  24.85 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.47 
 
 		 1144 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 435 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>