60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1073 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 535 aa  1082    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  58.53 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  54.25 
 
 		 529 aa  567  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  54.36 
 
 		 528 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  52.83 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  51.04 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  49.08 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  48.16 
 
 		 523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  47.97 
 
 		 523 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  47.97 
 
 		 523 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 315 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 327 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 330 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 320 aa  99  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 225 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.49 
 
 		 313 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  19.22 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  22.5 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  22.5 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  20.07 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  20.89 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  20.36 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  23.55 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  25.55 
 
 		 305 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 344 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  19.73 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  22.29 
 
 		 351 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 291 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 305 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  21.92 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 256 aa  47.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  18.94 
 
 		 389 aa  47.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  21.91 
 
 		 624 aa  47  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  24.12 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28.46 
 
 		 276 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  25.78 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 278 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 282 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  21.99 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 278 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  23.27 
 
 		 265 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  26.9 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 1235 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 864 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 278 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 288 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 		 426 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 		 322 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  21.53 
 
 		 310 aa  43.9  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 268 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 		 303 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 278 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>