57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001280 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  87.54 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  73.19 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  74.01 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  74.81 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  73.19 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  71.74 
 
 		 278 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2100  MscS mechanosensitive ion channel  71.74 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  26.06 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  32.26 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  19.5 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 476 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 657 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  37.5 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  22.86 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 		 583 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 479 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  24.79 
 
 		 682 aa  48.9  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  27.36 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  27.59 
 
 		 807 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 856 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  27.59 
 
 		 806 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.2 
 
 		 633 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  23.28 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29.36 
 
 		 624 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 830 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 385 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  25.55 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 814 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  26.06 
 
 		 803 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  23.58 
 
 		 825 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  26.86 
 
 		 545 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 840 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 840 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 803 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 803 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 404 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>