157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03630 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 476 aa  983    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  55.75 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  42.56 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 421 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  43.6 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 403 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 422 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 422 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  41.11 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  39.1 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  41.1 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  41.65 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  42.53 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 393 aa  316  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  43.71 
 
 		 424 aa  316  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  43.63 
 
 		 424 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  40.48 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  40.97 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.21 
 
 		 415 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 415 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  39.95 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  39.95 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  39.95 
 
 		 415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 422 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  42.15 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  41.53 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 414 aa  299  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.25 
 
 		 414 aa  299  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  41.25 
 
 		 414 aa  299  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.25 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  40.46 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  41.62 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  41.32 
 
 		 444 aa  289  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.75 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 459 aa  286  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  38.77 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  37.99 
 
 		 428 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  36.75 
 
 		 490 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  40.79 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  37.6 
 
 		 436 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  45.29 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  38.73 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  38.97 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  38.44 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  35.88 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  35.88 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 437 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  36.81 
 
 		 464 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  36.81 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  36.81 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  36.9 
 
 		 416 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  45.86 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  33.25 
 
 		 404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  42.54 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  22.8 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  23.89 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  23.89 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  23.08 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  23.89 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  23.89 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  28.29 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  24.69 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.43 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.7 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  20.73 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  22.04 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  23.44 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  22.27 
 
 		 391 aa  54.3  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  20.81 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>