164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6222 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 404 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  35.31 
 
 		 437 aa  249  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  37.35 
 
 		 444 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  34.82 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 436 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  39.89 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  34.9 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.9 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  34.9 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  34.9 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.9 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  35.68 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  35.68 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.9 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  35.68 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  35.38 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 414 aa  239  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 433 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.56 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  38.2 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 419 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  38.73 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 433 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 413 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  34.53 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  32.28 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.76 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  33.42 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.76 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  31.04 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  31.53 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 541 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.33 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  34.52 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 830 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  34.78 
 
 		 627 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  24.66 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  25.38 
 
 		 627 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  25.38 
 
 		 627 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 860 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.15 
 
 		 847 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 847 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 637 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.7 
 
 		 633 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 849 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>