208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2846 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 419 aa  852    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  48.32 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  36.65 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 403 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 433 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 416 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.68 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  39.32 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 416 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 420 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 421 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.17 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  38.17 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  37.53 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  39.63 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 426 aa  279  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  39.69 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  38.27 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  38.08 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  38.08 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.72 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  38.08 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 423 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  38.7 
 
 		 476 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  45.52 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  42.72 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  44.78 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  37.87 
 
 		 414 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  36.58 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  42.81 
 
 		 415 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  37.14 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  36.55 
 
 		 415 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  36.55 
 
 		 415 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 415 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.02 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.02 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  37.1 
 
 		 490 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  45.3 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  38.24 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  37.34 
 
 		 414 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  41.95 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  43.68 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  37.28 
 
 		 422 aa  249  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  43.12 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  31.04 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  26.56 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  24.34 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  23.13 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  28.35 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  22.35 
 
 		 662 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  20.83 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 283 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  26.99 
 
 		 265 aa  53.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  22.67 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>