224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0086 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  77.69 
 
 		 392 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  75.95 
 
 		 421 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 426 aa  866    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  77.86 
 
 		 422 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  77.86 
 
 		 422 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  75.54 
 
 		 422 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  76.67 
 
 		 422 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  75.95 
 
 		 421 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  76.43 
 
 		 422 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  75.95 
 
 		 421 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  75.95 
 
 		 421 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  68.82 
 
 		 420 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  72.75 
 
 		 393 aa  614  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  68.51 
 
 		 416 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  67.07 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  65.87 
 
 		 419 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  50.84 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  46.4 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  46.25 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  47.41 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.41 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.41 
 
 		 415 aa  362  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  47.41 
 
 		 415 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  46.02 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  46.02 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  46.02 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.15 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  47.15 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  45.8 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  46 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  44.09 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  47.2 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  45.01 
 
 		 414 aa  352  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  44.98 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  45.19 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  44.92 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  46.95 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  44.67 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  45.05 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  43.65 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.65 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.65 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  43.56 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  44.1 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  45.03 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  42.78 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  43.43 
 
 		 476 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.6 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  41.87 
 
 		 444 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  41.63 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  43.72 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  40.56 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  42.61 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  42.61 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  41.76 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  41.21 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  49.48 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  38.2 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  40.71 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  40.77 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  40.51 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  40.26 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  39.85 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  41.13 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  39.51 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 419 aa  279  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  38.44 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  39.29 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  41.07 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  39.61 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  39.19 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  39.19 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  40.95 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  39.59 
 
 		 541 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  25.73 
 
 		 624 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  21.07 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  22.22 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.09 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  25.7 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  21.03 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.22 
 
 		 563 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.55 
 
 		 624 aa  55.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  30.5 
 
 		 633 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  22.32 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  30.09 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  35.71 
 
 		 983 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  35.71 
 
 		 983 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>