155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2643 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  841    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  60.49 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  57.59 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  59.02 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  56.63 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  59.02 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  59.02 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  55.14 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  54.39 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  55.14 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  55.14 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  54.14 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  55.14 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  55.14 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  54.14 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  51.1 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.32 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  45.32 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.07 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  46.1 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  47.89 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  46.37 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  45.27 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  45.48 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  45.07 
 
 		 422 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  48.86 
 
 		 416 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  48.32 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  50.32 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  47.18 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.53 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  56.06 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  56.4 
 
 		 459 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  46.55 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  46.33 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  52.92 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  42.75 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  46.68 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  46.68 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  46.68 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  48.66 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  47.61 
 
 		 430 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  44.95 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  53.51 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  53.51 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  46.38 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  47.71 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  43.55 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  47.71 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  48.57 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  44.32 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  45.51 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  46.46 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  50.67 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  50 
 
 		 444 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  45.98 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  47.75 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  48.69 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  43.82 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  40.6 
 
 		 490 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  53.17 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  45.66 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  45.28 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  42.72 
 
 		 428 aa  278  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  42.72 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  51.7 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 541 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  21.05 
 
 		 624 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  22.1 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  22.52 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  22.52 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
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NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  22.52 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  22.52 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
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NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  23.32 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  22.86 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  22.19 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  24.51 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
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NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  21.82 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  23.82 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  23.26 
 
 		 343 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.92 
 
 		 633 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  23.26 
 
 		 343 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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