185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1436 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  79.47 
 
 		 433 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  82.85 
 
 		 436 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  82.85 
 
 		 430 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 432 aa  884    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  77.54 
 
 		 433 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  78.5 
 
 		 433 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  78.99 
 
 		 433 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  75.6 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  74.88 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  73.43 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  55.69 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  55.45 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  48.49 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.96 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  52.74 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  48.14 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  48.96 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  50.56 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  50.7 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  52.29 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  50.28 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  47.51 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  47.01 
 
 		 444 aa  359  6e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  46.21 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  48.74 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  43.2 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  43.46 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.46 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  43.46 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  43.46 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  43.46 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  43.46 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.46 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.44 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  46.8 
 
 		 423 aa  338  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  44.33 
 
 		 414 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  42.67 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  42.67 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  42.67 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  41.54 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  44.88 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  42.21 
 
 		 395 aa  326  6e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  43.95 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  40.1 
 
 		 416 aa  315  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  41.51 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  41.01 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  41.01 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  41.01 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 421 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  42.97 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  41.24 
 
 		 392 aa  312  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  44.05 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  40.46 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  40.82 
 
 		 422 aa  308  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  46.02 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  39.54 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  40.67 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.76 
 
 		 414 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.5 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  45.5 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  48.08 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  40.41 
 
 		 419 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  43.44 
 
 		 414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  46.58 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  41.57 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  36.73 
 
 		 490 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 541 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  24.2 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  23.71 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  22.35 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  22.54 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  23.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  23.72 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  21.58 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  28.8 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  22.84 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>