132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0771 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 428 aa  866    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  67.41 
 
 		 403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  61.37 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  56.22 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  55.84 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  45.72 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  46.04 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  46.04 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  45.21 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  47.78 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  46.4 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  45.66 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  46.36 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  43.42 
 
 		 420 aa  362  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  44.42 
 
 		 393 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  44.91 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  47.75 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  43.99 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  50.32 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  43.6 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  49.53 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  49.53 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  49.53 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  49.53 
 
 		 415 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  49.53 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  49.68 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  49.68 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.68 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  49.04 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  49.68 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.35 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  48.73 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  43.98 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 416 aa  335  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  48.73 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  43.78 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.6 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  45.11 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  42.71 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  42.46 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  42.78 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  42.27 
 
 		 414 aa  325  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.24 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.24 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  41.19 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  43.13 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  40.69 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  47.99 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  42.36 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 413 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 413 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  43.64 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  37.56 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  41.73 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 424 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  41.85 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  41.36 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  42.01 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  40.59 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  40.35 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  45.67 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  39.85 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  40.26 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  44.84 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  45.4 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  43.81 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  44.84 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  38.15 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  37.76 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  39.75 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 541 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  25.23 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.19 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  23.19 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  20.65 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  22.52 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  22.52 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  20.51 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  23.27 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>