191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1048 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  85.75 
 
 		 414 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  85.75 
 
 		 414 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 421 aa  847    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  85.99 
 
 		 414 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  68.5 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  68.74 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  62.26 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  62.26 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  62.26 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  62.26 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  62.02 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  63.12 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  63.12 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  63.37 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  61.27 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  60.49 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.39 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  45.39 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.69 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  47.33 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  44.9 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  46.35 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  47.95 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  45.6 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  45.31 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  44.26 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  45.37 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  45.11 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  44.87 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  44.33 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  45.06 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  47.59 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  47.85 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  44.39 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  44.31 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  45.61 
 
 		 424 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  44.6 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  44.6 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  44.9 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  40.1 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  42.68 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  55.05 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  47.74 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  43.52 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  54.51 
 
 		 413 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  44.47 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  46.49 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  45.5 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  45.81 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  45.69 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  44.96 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  46.23 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  47.73 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  42.13 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  45.58 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  39.8 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  45.9 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  46.17 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  47.58 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  48.69 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  45.65 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  39.9 
 
 		 406 aa  288  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  41.62 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  53.25 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  54.36 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 419 aa  279  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 541 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.06 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  20.19 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  23.21 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  24.89 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  25.32 
 
 		 343 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  24.89 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  24.89 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  24.89 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  24.83 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  22.63 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  22.36 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  22.63 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  22.63 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  24.5 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  22.63 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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