88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5695 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  100 
 
 		 638 aa  1316    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  100 
 
 		 638 aa  1316    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  42.81 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  43.96 
 
 		 608 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  40.24 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  40.07 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  31.52 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.53 
 
 		 633 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  26.47 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1490  TraG family protein  24.44 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.57 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  28.73 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.28 
 
 		 685 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  22.88 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.26 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.39 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  24.8 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.51 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.38 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  21.98 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  30.97 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  22.66 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  30.72 
 
 		 760 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  31.25 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  29.77 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  27.66 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.99 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.69 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  29.02 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  29.58 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  29.25 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.72 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  26.52 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  29.58 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  27.89 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  22.86 
 
 		 673 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.04 
 
 		 606 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  22.22 
 
 		 670 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  22.04 
 
 		 597 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  34.69 
 
 		 583 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  34.65 
 
 		 897 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  26.23 
 
 		 713 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  33.33 
 
 		 570 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  27.7 
 
 		 592 aa  54.3  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  24.05 
 
 		 648 aa  54.3  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  29.19 
 
 		 896 aa  54.3  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  34.02 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  32.29 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  32.29 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  32.41 
 
 		 603 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  24.32 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  34.38 
 
 		 594 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  34.02 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  23.11 
 
 		 784 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  25.99 
 
 		 620 aa  52  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  22.4 
 
 		 677 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  30.91 
 
 		 840 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  23.08 
 
 		 571 aa  51.6  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  21.08 
 
 		 912 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  31.37 
 
 		 677 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  29.1 
 
 		 723 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  26.83 
 
 		 657 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  25.23 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.32 
 
 		 636 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  28.33 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  26.49 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  21.91 
 
 		 714 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.86 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  26.19 
 
 		 639 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.69 
 
 		 798 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  25.73 
 
 		 809 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  22.5 
 
 		 635 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  21.9 
 
 		 637 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  24.86 
 
 		 828 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  27.2 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  24.86 
 
 		 834 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  25.28 
 
 		 583 aa  44.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.95 
 
 		 616 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.66 
 
 		 699 aa  44.3  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.95 
 
 		 557 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  28.24 
 
 		 827 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  24.11 
 
 		 700 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  25 
 
 		 666 aa  43.9  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>