192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1362 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  100 
 
 		 663 aa  1337    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  40.83 
 
 		 827 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  37.7 
 
 		 912 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  43.34 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  38.4 
 
 		 682 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  33.82 
 
 		 661 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  30.38 
 
 		 648 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  32.4 
 
 		 673 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  25.71 
 
 		 625 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  27.47 
 
 		 598 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  26.33 
 
 		 677 aa  144  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  26.42 
 
 		 627 aa  144  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  25.3 
 
 		 590 aa  136  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  30.25 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  30.25 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  28.72 
 
 		 634 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  26.74 
 
 		 666 aa  112  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  23.55 
 
 		 661 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  24.7 
 
 		 699 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  25.39 
 
 		 823 aa  107  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  25.83 
 
 		 674 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  25 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.84 
 
 		 687 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  25.93 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  26.36 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  26.36 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.62 
 
 		 663 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  27.07 
 
 		 668 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  23.8 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  27.02 
 
 		 666 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  26.39 
 
 		 661 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  24.89 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  25.11 
 
 		 714 aa  102  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  25.76 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  25.94 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  25.92 
 
 		 660 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  25.75 
 
 		 699 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  25.32 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  26.46 
 
 		 675 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  25.91 
 
 		 668 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  26.39 
 
 		 678 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  23.37 
 
 		 606 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  24.95 
 
 		 648 aa  100  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  25.52 
 
 		 695 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  26.09 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  25.7 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  26.05 
 
 		 660 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  26.76 
 
 		 445 aa  98.6  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  26.25 
 
 		 664 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  26.03 
 
 		 665 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  31.19 
 
 		 610 aa  98.2  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  25.37 
 
 		 664 aa  98.2  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  26.03 
 
 		 672 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  27.06 
 
 		 687 aa  97.4  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  26.03 
 
 		 665 aa  97.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  24.57 
 
 		 630 aa  97.1  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  25.51 
 
 		 662 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  26.19 
 
 		 666 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  26.89 
 
 		 644 aa  97.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  27.29 
 
 		 661 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  26.92 
 
 		 661 aa  97.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  25.48 
 
 		 670 aa  96.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  26.23 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  27.6 
 
 		 713 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  26.33 
 
 		 678 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  26.02 
 
 		 673 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  25.81 
 
 		 669 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  25.81 
 
 		 670 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  25.48 
 
 		 667 aa  95.1  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  26.03 
 
 		 665 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  26.71 
 
 		 661 aa  94.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  25.7 
 
 		 666 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  26.25 
 
 		 669 aa  94.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  24.26 
 
 		 641 aa  94.4  7e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  27.33 
 
 		 660 aa  94.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  26.04 
 
 		 667 aa  94.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  26.93 
 
 		 663 aa  94  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  26.39 
 
 		 661 aa  94  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  25.79 
 
 		 659 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  26.03 
 
 		 664 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  23.92 
 
 		 626 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  26.93 
 
 		 665 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  25.58 
 
 		 659 aa  91.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  27 
 
 		 660 aa  91.3  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  26.56 
 
 		 666 aa  91.3  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  26.54 
 
 		 662 aa  90.5  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  26.68 
 
 		 670 aa  90.5  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  24.78 
 
 		 723 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  24.94 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  25.99 
 
 		 670 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  23.82 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  25.11 
 
 		 648 aa  84  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  25.93 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  26.07 
 
 		 762 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.6 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  28.61 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  25.88 
 
 		 676 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  23.67 
 
 		 548 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  25.12 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>