152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0918 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  100 
 
 		 677 aa  1416    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  37.15 
 
 		 598 aa  323  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  34.82 
 
 		 590 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  36.16 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  36.27 
 
 		 610 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  38.1 
 
 		 332 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  25.83 
 
 		 661 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  28.44 
 
 		 673 aa  157  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  26.91 
 
 		 445 aa  150  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  26.96 
 
 		 663 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  29.08 
 
 		 625 aa  140  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  30.51 
 
 		 648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  26.15 
 
 		 912 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  27.1 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  24.91 
 
 		 827 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  25.13 
 
 		 606 aa  98.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  26.88 
 
 		 606 aa  95.5  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  25.55 
 
 		 682 aa  91.3  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.58 
 
 		 661 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  24.7 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  22.29 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  22.67 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  23.23 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  23.75 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  23.5 
 
 		 667 aa  75.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  22.57 
 
 		 676 aa  75.1  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  22.18 
 
 		 687 aa  75.1  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  22.95 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  22.95 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.41 
 
 		 648 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  22.57 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  22.42 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  23.13 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  22.88 
 
 		 659 aa  73.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  23.09 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  23.09 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  22.42 
 
 		 675 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  23.09 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  22.37 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  22.42 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  23.32 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  23.32 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  22.48 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  22.77 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  23.54 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  22.87 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.08 
 
 		 663 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  21.85 
 
 		 662 aa  72  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.27 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  22.42 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  21.74 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  21.91 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  21.94 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  22.12 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  27.27 
 
 		 877 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  21.97 
 
 		 667 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  22.2 
 
 		 666 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5160  TRAG family protein  21.83 
 
 		 638 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  22.47 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  21.46 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  20.7 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  20.61 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  22.5 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  23.43 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  21.84 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  21.83 
 
 		 660 aa  67.8  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  22.03 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  22.29 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  21.9 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22 
 
 		 576 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  21.51 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  20.58 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  23.18 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  23.43 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  21.78 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  31.15 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  22.94 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.27 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  19.78 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  22.2 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  25.09 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  22.67 
 
 		 670 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  24.16 
 
 		 603 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  21.73 
 
 		 756 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  22.46 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  21.44 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  24.42 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  23.23 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  20.91 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  21.29 
 
 		 592 aa  60.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  20.28 
 
 		 583 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  22.08 
 
 		 664 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  20.57 
 
 		 660 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  21.12 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  22.22 
 
 		 758 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  26.38 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  19.75 
 
 		 902 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.87 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  20.3 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>